Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A1P02462 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms