Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYF2O95926 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYF2O95926 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYF2O95926 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYF2O95926 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYF2O95926 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYF2O95926 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYF2O95926 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYF2O95926 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYF2O95926 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYF2O95926 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYF2O95926 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYF2O95926 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYF2O95926 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYF2O95926 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYF2O95926 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYF2O95926 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYF2O95926 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYF2O95926 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYF2O95926 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYF2O95926 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYF2O95926 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYF2O95926 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYF2O95926 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYF2O95926 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYF2O95926 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYF2O95926 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYF2O95926 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYF2O95926 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYF2O95926 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYF2O95926 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYF2O95926 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYF2O95926 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYF2O95926 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYF2O95926 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYF2O95926 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYF2O95926 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYF2O95926 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYF2O95926 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYF2O95926 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYF2O95926 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYF2O95926 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYF2O95926 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYF2O95926 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYF2O95926 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYF2O95926 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYF2O95926 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYF2O95926 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYF2O95926 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYF2O95926 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYF2O95926 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYF2O95926 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYF2O95926 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYF2O95926 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYF2O95926 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYF2O95926 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYF2O95926 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYF2O95926 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYF2O95926 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYF2O95926 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYF2O95926 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYF2O95926 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYF2O95926 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYF2O95926 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYF2O95926 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms