Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM1O95202 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM1O95202 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM1O95202 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM1O95202 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM1O95202 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM1O95202 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM1O95202 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM1O95202 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM1O95202 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM1O95202 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM1O95202 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM1O95202 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM1O95202 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM1O95202 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM1O95202 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM1O95202 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM1O95202 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM1O95202 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM1O95202 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM1O95202 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM1O95202 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM1O95202 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM1O95202 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM1O95202 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM1O95202 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM1O95202 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM1O95202 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM1O95202 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM1O95202 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM1O95202 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM1O95202 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM1O95202 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM1O95202 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM1O95202 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM1O95202 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM1O95202 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM1O95202 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM1O95202 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM1O95202 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM1O95202 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM1O95202 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM1O95202 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM1O95202 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM1O95202 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM1O95202 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM1O95202 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM1O95202 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM1O95202 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM1O95202 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM1O95202 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM1O95202 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM1O95202 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM1O95202 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM1O95202 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM1O95202 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM1O95202 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM1O95202 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM1O95202 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM1O95202 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM1O95202 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM1O95202 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM1O95202 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LETM1O95202 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LETM1O95202 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LETM1O95202 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM1O95202 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM1O95202 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM1O95202 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM1O95202 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM1O95202 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM1O95202 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM1O95202 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms