Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP19O94966 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP19O94966 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP19O94966 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP19O94966 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP19O94966 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP19O94966 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP19O94966 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP19O94966 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP19O94966 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP19O94966 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP19O94966 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP19O94966 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP19O94966 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP19O94966 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP19O94966 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP19O94966 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP19O94966 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP19O94966 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP19O94966 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP19O94966 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP19O94966 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP19O94966 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP19O94966 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP19O94966 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP19O94966 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP19O94966 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP19O94966 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP19O94966 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP19O94966 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP19O94966 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP19O94966 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP19O94966 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP19O94966 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP19O94966 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP19O94966 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP19O94966 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP19O94966 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP19O94966 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP19O94966 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP19O94966 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP19O94966 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
USP19O94966 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP19O94966 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
USP19O94966 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP19O94966 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP19O94966 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP19O94966 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP19O94966 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP19O94966 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP19O94966 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP19O94966 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP19O94966 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP19O94966 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
USP19O94966 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP19O94966 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP19O94966 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP19O94966 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP19O94966 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP19O94966 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP19O94966 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP19O94966 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP19O94966 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP19O94966 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP19O94966 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP19O94966 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP19O94966 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP19O94966 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP19O94966 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP19O94966 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP19O94966 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP19O94966 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP19O94966 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP19O94966 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP19O94966 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP19O94966 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
USP19O94966 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
USP19O94966 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP19O94966 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP19O94966 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP19O94966 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP19O94966 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP19O94966 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP19O94966 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP19O94966 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP19O94966 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP19O94966 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP19O94966 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP19O94966 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP19O94966 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP19O94966 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP19O94966 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP19O94966 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
USP19O94966 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP19O94966 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP19O94966 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP19O94966 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP19O94966 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP19O94966 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
USP19O94966 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms