Protein–RNA interactions for Protein: O75665

OFD1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OFD1O75665 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OFD1O75665 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OFD1O75665 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
OFD1O75665 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OFD1O75665 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OFD1O75665 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OFD1O75665 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OFD1O75665 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OFD1O75665 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OFD1O75665 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OFD1O75665 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OFD1O75665 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OFD1O75665 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OFD1O75665 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OFD1O75665 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OFD1O75665 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OFD1O75665 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OFD1O75665 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OFD1O75665 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OFD1O75665 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OFD1O75665 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OFD1O75665 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OFD1O75665 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OFD1O75665 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OFD1O75665 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OFD1O75665 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OFD1O75665 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OFD1O75665 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OFD1O75665 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OFD1O75665 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OFD1O75665 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OFD1O75665 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OFD1O75665 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OFD1O75665 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OFD1O75665 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OFD1O75665 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OFD1O75665 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OFD1O75665 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OFD1O75665 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OFD1O75665 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OFD1O75665 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OFD1O75665 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OFD1O75665 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OFD1O75665 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OFD1O75665 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OFD1O75665 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OFD1O75665 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OFD1O75665 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OFD1O75665 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OFD1O75665 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OFD1O75665 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OFD1O75665 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OFD1O75665 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OFD1O75665 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OFD1O75665 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OFD1O75665 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OFD1O75665 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OFD1O75665 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OFD1O75665 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OFD1O75665 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OFD1O75665 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OFD1O75665 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OFD1O75665 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OFD1O75665 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OFD1O75665 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OFD1O75665 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OFD1O75665 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OFD1O75665 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OFD1O75665 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OFD1O75665 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OFD1O75665 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OFD1O75665 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OFD1O75665 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OFD1O75665 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OFD1O75665 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OFD1O75665 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OFD1O75665 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OFD1O75665 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OFD1O75665 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms