Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX3O75364 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX3O75364 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX3O75364 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX3O75364 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX3O75364 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX3O75364 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX3O75364 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX3O75364 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX3O75364 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX3O75364 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX3O75364 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX3O75364 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX3O75364 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX3O75364 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX3O75364 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX3O75364 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX3O75364 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX3O75364 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX3O75364 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX3O75364 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX3O75364 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX3O75364 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX3O75364 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX3O75364 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX3O75364 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX3O75364 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX3O75364 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX3O75364 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX3O75364 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX3O75364 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX3O75364 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX3O75364 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX3O75364 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX3O75364 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX3O75364 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX3O75364 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX3O75364 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX3O75364 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX3O75364 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms