Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDIL3O43854 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms