Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms