Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCP110O43303 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCP110O43303 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCP110O43303 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCP110O43303 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCP110O43303 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCP110O43303 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCP110O43303 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCP110O43303 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCP110O43303 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCP110O43303 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCP110O43303 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCP110O43303 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCP110O43303 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCP110O43303 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCP110O43303 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCP110O43303 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCP110O43303 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCP110O43303 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCP110O43303 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCP110O43303 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCP110O43303 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCP110O43303 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCP110O43303 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCP110O43303 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCP110O43303 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCP110O43303 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCP110O43303 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCP110O43303 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCP110O43303 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCP110O43303 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCP110O43303 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCP110O43303 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCP110O43303 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCP110O43303 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCP110O43303 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCP110O43303 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCP110O43303 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCP110O43303 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCP110O43303 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCP110O43303 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCP110O43303 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCP110O43303 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCP110O43303 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCP110O43303 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCP110O43303 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCP110O43303 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCP110O43303 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCP110O43303 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCP110O43303 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCP110O43303 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCP110O43303 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCP110O43303 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCP110O43303 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCP110O43303 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCP110O43303 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCP110O43303 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCP110O43303 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCP110O43303 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCP110O43303 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCP110O43303 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCP110O43303 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCP110O43303 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCP110O43303 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCP110O43303 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCP110O43303 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCP110O43303 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCP110O43303 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCP110O43303 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCP110O43303 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCP110O43303 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCP110O43303 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCP110O43303 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCP110O43303 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCP110O43303 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCP110O43303 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCP110O43303 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCP110O43303 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCP110O43303 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms