Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD3O43242 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms