Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN3O15551 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms