Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP290O15078 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP290O15078 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP290O15078 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP290O15078 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP290O15078 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP290O15078 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP290O15078 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP290O15078 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP290O15078 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP290O15078 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP290O15078 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP290O15078 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP290O15078 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP290O15078 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP290O15078 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP290O15078 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP290O15078 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP290O15078 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP290O15078 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP290O15078 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP290O15078 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP290O15078 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP290O15078 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP290O15078 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP290O15078 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP290O15078 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP290O15078 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP290O15078 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP290O15078 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP290O15078 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP290O15078 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP290O15078 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP290O15078 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP290O15078 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP290O15078 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP290O15078 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP290O15078 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP290O15078 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP290O15078 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP290O15078 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP290O15078 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP290O15078 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP290O15078 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP290O15078 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP290O15078 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP290O15078 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP290O15078 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP290O15078 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP290O15078 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP290O15078 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP290O15078 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP290O15078 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP290O15078 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP290O15078 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP290O15078 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP290O15078 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP290O15078 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP290O15078 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP290O15078 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP290O15078 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP290O15078 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP290O15078 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP290O15078 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP290O15078 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP290O15078 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP290O15078 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP290O15078 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP290O15078 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP290O15078 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP290O15078 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP290O15078 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP290O15078 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP290O15078 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP290O15078 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP290O15078 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP290O15078 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP290O15078 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
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