Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR3AO14802 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms