Protein–RNA interactions for Protein: O00712

NFIB, Nuclear factor 1 B-type, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIBO00712 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIBO00712 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIBO00712 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIBO00712 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIBO00712 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIBO00712 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIBO00712 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIBO00712 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIBO00712 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIBO00712 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIBO00712 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIBO00712 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIBO00712 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIBO00712 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIBO00712 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIBO00712 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIBO00712 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIBO00712 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIBO00712 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIBO00712 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIBO00712 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIBO00712 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIBO00712 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIBO00712 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIBO00712 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIBO00712 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIBO00712 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIBO00712 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIBO00712 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIBO00712 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIBO00712 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIBO00712 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIBO00712 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIBO00712 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIBO00712 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIBO00712 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIBO00712 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIBO00712 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIBO00712 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIBO00712 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIBO00712 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIBO00712 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIBO00712 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIBO00712 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIBO00712 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIBO00712 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIBO00712 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIBO00712 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIBO00712 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIBO00712 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIBO00712 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIBO00712 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIBO00712 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIBO00712 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIBO00712 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIBO00712 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIBO00712 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIBO00712 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIBO00712 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIBO00712 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIBO00712 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIBO00712 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIBO00712 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIBO00712 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIBO00712 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIBO00712 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIBO00712 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIBO00712 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIBO00712 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIBO00712 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIBO00712 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIBO00712 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIBO00712 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIBO00712 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIBO00712 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIBO00712 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIBO00712 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIBO00712 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIBO00712 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIBO00712 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIBO00712 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIBO00712 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIBO00712 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIBO00712 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIBO00712 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIBO00712 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIBO00712 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIBO00712 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIBO00712 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIBO00712 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIBO00712 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIBO00712 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIBO00712 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIBO00712 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIBO00712 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIBO00712 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIBO00712 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIBO00712 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIBO00712 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIBO00712 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms