Protein–RNA interactions for Protein: O00418

EEF2K, Eukaryotic elongation factor 2 kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF2KO00418 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF2KO00418 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms