Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SUPT5HO00267 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms