Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms