Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QKU1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QKU1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QKU1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QKU1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QKU1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QKU1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QKU1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QKU1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QKU1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QKU1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QKU1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QKU1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QKU1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QKU1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QKU1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QKU1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QKU1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QKU1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QKU1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QKU1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QKU1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QKU1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QKU1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QKU1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QKU1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QKU1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QKU1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QKU1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QKU1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QKU1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QKU1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QKU1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QKU1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QKU1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QKU1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QKU1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QKU1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QKU1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QKU1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QKU1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QKU1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QKU1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QKU1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QKU1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QKU1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QKU1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QKU1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QKU1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QKU1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QKU1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QKU1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QKU1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QKU1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QKU1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QKU1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QKU1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QKU1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QKU1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QKU1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QKU1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QKU1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QKU1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QKU1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QKU1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QKU1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QKU1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QKU1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QKU1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QKU1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QKU1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QKU1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QKU1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QKU1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QKU1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QKU1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QKU1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QKU1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms