Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA8SH3BPF8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms