Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCRIP1C9JLW8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms