Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms