Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms