Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms