Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms