Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms