Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms