Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GMNCA6NCL1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GMNCA6NCL1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GMNCA6NCL1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GMNCA6NCL1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GMNCA6NCL1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GMNCA6NCL1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GMNCA6NCL1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GMNCA6NCL1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GMNCA6NCL1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GMNCA6NCL1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMNCA6NCL1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMNCA6NCL1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMNCA6NCL1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMNCA6NCL1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMNCA6NCL1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMNCA6NCL1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMNCA6NCL1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMNCA6NCL1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMNCA6NCL1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMNCA6NCL1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GMNCA6NCL1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms