Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms