Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 SKAP1-201ENST00000336915 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ARG1-203ENST00000368087 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 SLC25A14-201ENST00000218197 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ITIH3-202ENST00000449956 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AOX1-202ENST00000374700 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 CPSF7-206ENST00000448745 1749 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 SYCP3-201ENST00000266743 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 TRNT1-203ENST00000339437 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 HLA-DRA-201ENST00000374982 1169 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 RPL4P5-201ENST00000413888 1276 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC244157.1-201ENST00000415642 163 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC009226.1-203ENST00000418850 741 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 RPL13AP7-201ENST00000425147 611 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC098613.1-201ENST00000451485 656 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 IFNA22P-201ENST00000458710 570 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 TAF8-205ENST00000465926 1222 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC107302.1-201ENST00000467059 1032 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC006534.1-201ENST00000469329 541 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 PRSS1-204ENST00000486171 803 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 NR1I3-219ENST00000504010 944 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC027343.3-201ENST00000504494 564 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 SEMA6A-AS1-201ENST00000507558 436 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 HSPE1P10-201ENST00000508631 558 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC093857.1-201ENST00000511603 760 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC021546.1-201ENST00000518927 1031 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 LINC00958-203ENST00000527945 1121 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 LINC01579-201ENST00000553818 561 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC109630.1-201ENST00000558846 730 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ADAL-204ENST00000562188 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 CAPN3-219ENST00000569136 1029 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 NDUFA3P6-201ENST00000571486 250 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC004147.5-201ENST00000581727 536 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 SNRPD2-208ENST00000590212 454 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ZNF799-204ENST00000595766 576 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC007389.1-208ENST00000607539 512 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC073869.3-201ENST00000609270 580 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 Metazoa_SRP.110-201ENST00000611670 282 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 Metazoa_SRP.44-201ENST00000615037 294 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 MIR6124-201ENST00000617177 85 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 PRSS3P3-202ENST00000618042 682 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC011483.4-201ENST00000623621 585 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 SCYL2-211ENST00000635101 3948 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 RAB27A-202ENST00000396307 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC024337.1-201ENST00000558860 1562 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 STAG3-202ENST00000394018 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC127024.8-201ENST00000623719 2094 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 MTF2-214ENST00000545708 4046 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ZNF143-204ENST00000396604 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 DNAJC18-201ENST00000302060 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ABRAXAS1-208ENST00000515303 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 PPIL4-201ENST00000253329 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 MLANA-203ENST00000381477 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 GRIK2-207ENST00000421544 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 TMPPE-202ENST00000416695 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 FBXW11P1-201ENST00000393804 1474 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ATP5O-201ENST00000290299 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AL137845.1-201ENST00000340681 1110 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 BZW2-203ENST00000407633 898 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 TRPC6P-201ENST00000421233 880 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AL355863.1-201ENST00000424331 293 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AL353779.2-201ENST00000424917 308 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AL109810.1-201ENST00000435008 495 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 LINC00578-204ENST00000446548 519 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC010907.2-201ENST00000456450 693 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ZBTB20-AS5-201ENST00000465249 622 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ZBED5-AS1-201ENST00000501079 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC017091.1-201ENST00000513551 1061 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 KRTAP9-12P-201ENST00000514388 532 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 IGLV3-13-201ENST00000518475 223 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AP000879.1-201ENST00000526174 976 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC010319.1-201ENST00000526892 1258 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 FDPSP4-201ENST00000534629 1049 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AL139023.1-201ENST00000548280 508 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 GLYCAM1-204ENST00000550226 781 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AP4S1-206ENST00000554609 1012 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ASB9P1-201ENST00000557146 793 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AL049833.1-201ENST00000557745 840 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC233702.4-201ENST00000581610 304 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC080112.1-201ENST00000583752 487 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 MRPS5P4-201ENST00000592830 325 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AP001425.1-202ENST00000605450 1063 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ASNSD1-207ENST00000607535 579 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC004853.2-201ENST00000609561 916 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 RN7SL796P-201ENST00000613991 291 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 Metazoa_SRP.126-201ENST00000618354 266 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 OR4Q2-202ENST00000622436 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC098476.1-201ENST00000623173 1025 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC008870.5-201ENST00000624143 650 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AL022329.3-201ENST00000624255 352 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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