Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SLAMF7-203ENST00000368043 2689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 SFR1-202ENST00000369729 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 CTNNA2-217ENST00000540488 2792 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 SETD7-207ENST00000608958 5281 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 FCGR3B-202ENST00000367964 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 GPN1-202ENST00000407583 1395 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 MRPL1-201ENST00000315567 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 COLGALT2-202ENST00000367520 2325 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ZNF649-201ENST00000354957 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 IQGAP1-214ENST00000560738 3602 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 TLR1-202ENST00000502213 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AC006269.1-201ENST00000636752 2789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ZNF781-201ENST00000358582 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 TRIM43-201ENST00000272395 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 UBAP2L-202ENST00000343815 3411 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 CASP8-205ENST00000358485 2930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AC131392.2-201ENST00000505635 4332 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ITIH3-202ENST00000449956 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 HSPB11-203ENST00000371377 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 LDHAP4-201ENST00000397561 998 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 PGAM1P6-201ENST00000425684 747 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 TTC4P1-201ENST00000427137 1158 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ELOA-AS1-201ENST00000427796 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 VN2R9P-201ENST00000431428 953 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AP000532.1-201ENST00000440999 177 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AL022313.2-201ENST00000442579 372 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AL353072.1-201ENST00000446021 442 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 HCG25-220ENST00000450514 759 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 RN7SL761P-201ENST00000463259 278 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 CREM-237ENST00000488328 1049 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ASPH-225ENST00000522835 1258 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AC069287.2-201ENST00000526963 574 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AC026369.3-201ENST00000540226 586 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 CACNA1C-AS2-201ENST00000545526 609 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 PRR13-206ENST00000549135 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AC109630.1-201ENST00000558846 730 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 HNRNPCP3-201ENST00000560385 875 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 NDUFA3P6-201ENST00000571486 250 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ASNSD1-207ENST00000607535 579 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AC116050.1-201ENST00000609777 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 MIR6124-201ENST00000617177 85 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 Metazoa_SRP.126-201ENST00000618354 266 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AC239585.2-201ENST00000624269 557 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 KRT7-214ENST00000638501 398 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 RDM1-229ENST00000639942 420 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AL445250.1-204ENST00000641775 1723 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 UTP15-202ENST00000508491 1828 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 CAST-244ENST00000515663 1473 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 CD101-201ENST00000256652 3283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 C1orf87-201ENST00000371201 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 GDNF-AS1-203ENST00000514532 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 MGAM2-203ENST00000550469 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 PTPN3-201ENST00000262539 6832 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 OR9Q1-202ENST00000612174 2134 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ZKSCAN5-203ENST00000451158 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 RCAN1-208ENST00000482533 2686 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 TBC1D31-202ENST00000327098 2985 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ABLIM3-202ENST00000326685 4164 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 LINC02367-201ENST00000567749 4388 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 CLCC1-206ENST00000369970 2078 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 NHLRC3-201ENST00000379599 3275 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 CPNE8-201ENST00000331366 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 PPARG-209ENST00000397026 2029 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 PSG8-203ENST00000404209 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ATP5J2-202ENST00000359832 323 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 RNASE1-203ENST00000397970 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AL592049.1-201ENST00000422490 1188 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AL109810.1-201ENST00000435008 495 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 LINC00379-202ENST00000438789 464 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 LINC01526-201ENST00000441949 520 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 IFNA22P-201ENST00000458710 570 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 WWTR1-IT1-201ENST00000463167 451 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 EGFLAM-207ENST00000506135 889 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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