Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX8Q9Y5X2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms