Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms