Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
YBX2Q9Y2T7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms