Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM2AQ9Y2K7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms