Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FARSAQ9Y285 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms