Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms