Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms