Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms