Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms