Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms