Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
INO80Q9ULG1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms