Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms