Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms