Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GTF3C4Q9UKN8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C4Q9UKN8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms