Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms