Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBE1Q9UJT0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms