Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP25Q9UHP3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms