Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWAP70Q9UH65 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SWAP70Q9UH65 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms