Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5BQ9UGL1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5BQ9UGL1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms