Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms